Палеонтологическая коллекция
Хранитель Я.А. Попов.
Насчитывает 19216 образцов. Как самостоятельная единица коллекция начала формироваться в 70-е годы ХХ в. Она состоит в основном из материалов, собранных известными исследователями и коллекционерами А.А. Эрлангером, М.А. Ахметьевым, Р.Ф. Геккером, П.В. Александровым, В.С. Плотниковым, В.В. Меннером, Н.В. Покровской, Г.Н. Садовниковым, а также отдельных образцов других сборщиков. В 90-х годах ряд интересных образцов был целенаправленно приобретен для новой экспозиции музея.
Первые образцы коллекции были закуплены А.Ф. Котсом за рубежом в первые годы существования музея. Это так называемые «литографские сланцы» с отпечатками водных членистоногих из Золенгофена – всемирно известного местонахождения позднеюрской фауны в Баварии (Германия). Эти образцы также старейшие в коллекции музея по времени сбора, согласно сохранившейся документации проведенного 1876 году.
Коллекция содержит обширный материал из палеозойских отложений Подмосковья (имеются стратотипы некоторых ярусов), Ленинградской области, центральных районов Европейской России, девона Воронежской области, мезозоя Подмосковья, Поволжья, полуострова Мангышлак и Крыма, палеогена Украины и Крыма, нижнего палеозоя Прибалтики и Сибири, континентального верхнего палеозоя и триаса Сибири.
В коллекции представлены все основные группы органического мира. Имеются остатки сине-зеленых водорослей, плаунообразных, членистостебельных, цикадовых, гинкговых, кордаитов, хвойных, покрытосеменных. Крайне интересны образцы растений с сохранившейся клеточной структурой. Достаточно многочисленны крупные фораминиферы-фузулиниды и нуммулиты, губки, кольчатые черви, морские ежи. Имеются археоциаты, гидроиды, медузы, низшие раки, крабы, насекомые (в том числе и инклюзы в янтаре), морские звезды, граптолиты. Много различных кораллов, трилобитов, морских лилий, среди которых наибольший интерес представляют экземпляры из каменноугольных отложений Подмосковья, брюхоногих и двустворчатых моллюсков (палеозойских, мезозойских и, главным образом, кайнозойских), головоногих моллюсков, в том числе довольно редкие палеозойские наутилиды, плеченогих. Позвоночные представлены немногочисленными, как правило, фрагментарными костными остатками рыб, рептилий и млекопитающих. Среди них стоит отметить остатки рыб из местонахождений Германии, США и России, земноводных из Моравии (Чехия), рептилий из Подмосковья и Монголии. Небольшое остеологическое собрание представителей мамонтовой фауны (кости шерстистого носорога, лошади, первобытного бизона, мамонта) сформировано благодаря материалам К.К. Флерова, Е.Н. Мащенко, В.В. Митты. Особу ценность представляет коллекция аберрантных целых и фрагментарных бивней шерстистого мамонта, демонстрирующая редкие формы отклонений роста. Часть образцов, послуживших К.К. Флерову основой для его исследований и публикаций, посвященных ископаемым бизонам, также хранится в коллекции музея.
Среди палеоботанических материалов наибольший интерес представляют остатки малоизвестных плаунообразных, папоротников и своеобразных хвойных из пограничных отложений пермской и триасовой систем севера Сибири. Иногда степень сохранности образцов настолько хороша, что можно изучать клеточное строение растительных остатков.
В настоящее время коллекция активно пополняется усилиями сотрудников музея Г.Н. Садовникова, Я.А. Попова и Э.В. Мычко.
Зубы ископаемой акулы Striatolamia usakensis Glickman. Материал из коллекции Л.С. Гликмана.
Аммонит Simbirskites sp.
Брахиоподы Choristites sp.